根据2021年的湿地资源调查，深圳市湿地总面积34788.43公顷。湿地类型有4类20型，其中，近海与海岸湿地26774.85公顷，占76.96%；河流湿地1635.01公顷，占4.70%；沼泽湿地64.84公顷，占0.19%；人工湿地6313.73公顷，占18.15%。深圳市湿地植物种类丰富，共有维管植物123科323属480种，约占深圳市维管植物总数的23%。其中水蕨为国家二级重点保护植物，主要分布在西涌河、茅洲河光明段、笔架山公园、华侨城国家湿地公园、福田红树林生态公园等区域。湿地外来入侵植物常见的有薇甘菊、南美蟛蜞菊、鬼针草等，分布较为广泛。